Выборг находится на территории Балтийского щита, где близко к поверхности выходят породы раннепротерозойского периода. Они покрыты озёрными и озёрно-аллювиальными отложениями четвертичного периода. Характерными ледниковыми формами рельефа являются «бараньи лбы».
На части территории города сохранились коренные еловые и сосновые леса. Помимо обычной городской фауны — воробьёв, голубей, ворон, чаек, уток, обитающих в городских водоёмах, на лесистых окраинах Выборга можно встретить животных и птиц,обычных для лесов Карельского перешейка: зайцев, белок, лосей, кабанов, лисиц, рысей, ондатр, выдр, норок.
В акваториях города встречаются виды рыб, характерные в целом для этой части Финского залива: щука, окунь, судак, лещ, плотва, краснопёрка и другие.
